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【平台介绍】生物样本信息资源中心
2022-04-07    责任编辑:庞亮   (点击: )

西安交通大学第一附属医院生物样本信息资源中心位于西安交通大学第一附属医院科教楼负一层,占地面积约2300㎡。中心按照国际样本库最高标准ISBERISO20387等标准建设,并获得国家科技部人类遗传资源管理办公室审批的保藏资质(批准号:国科遗办审字(20182019号)。中心存储容量700万份,是目前西北最大的院级综合性生物样本库。

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组织架构:

中心集干库、湿库和活库于一体,建成以样本冻存为主体,涵盖组织病理、生物大分子、细胞实验、耐药菌与噬菌体研究、信息数据五大体系,融合生物样本实体、样本表型及组学数据、以及活细胞的科研服务平台,是规范化、标准化、信息化的人类遗传资源保藏中心,是临床研究与基础研究的纽带。

中心开创数据驱动样本科学可持续发展的安全服务理念,建成集生物样本管理、干库信息管理及多组学数据管理的数字化网络系统。将有限的生物样本与无限的信息数据有机结合,助推生物医学研究可持续发展。“湿库”实现生物样本从采集、转运、接收、处理、储存与应用的全生命周期冷链监管体系。“干库”整合医院HISEMRPACSLIS、病理、电生理等多个信息系统的临床数据,重建从多模态数据到结构化数据一站式信息检索集成的表型数据体系;基于丰富的生物样本资源,依托多研究平台,进行基因组学、蛋白质组学、转录组学、代谢组学等研究,形成组学数据体系。干湿两库并行的同时,探索“活库”建设标准,建立组织类型的干细胞、基因重编程细胞、类器官等多维体外仿生模型,为医学研究与国际化接轨提供支撑。

项目支撑:

中心支撑了“西北自然人群队列总体规划、标准制定及方法研究”、“西北地区慢病防控科技综合示范研究”、“新生儿局灶性白质损伤预后评估的MRI新技术集成及其临床应用”、“不同发育阶段肠道菌群特征及其对发育的影响”等国家重点研发计划项目,“西北地区恶性肿瘤新药临床评价示范性技术平台”、国家医学中心、神经、癌症、心血管、传染病、精神、妇产等专业类别国家区域医疗中心的申报与建设,及多项国家级、省部级等各类科学研究项目。面对突发新冠疫情,作为独家二级生物安全备案的样本库,中心被陕西省卫生健康委指定为唯一新型冠状病毒肺炎样本保存的医疗机构,助力抗疫科学研究,安全保存新冠样本。

未来规划:

生物样本信息资源中心旨在系统性地保藏必需的研究性资源,建设跨学科研究平台,为多学科研究人员提供服务。目前建成以病例为中心,整合临床诊疗信息及生物样本信息为一体的国际化、标准化的科研服务平台。未来将分步实现以医院为基础,面向全省,辐射西北,以主要疾病为中心的分散式与集中式存储相结合的网络联盟库;建立以第三方服务为特点,技术支持与共享服务为主要业务,成为具备国际标准的生物样本管理服务中心,助力大规模临床与基础研究。

为推进西部人类遗传资源保藏利用的规范化,加强西部区域内的合作与交流,“十四五”期间我院生物样本库将与四川大学华西医院共同牵头,在中国研究型医院学会临床数据与样本资源库专业委员会的大力支持下,发起成立西部中国研究型医院生物样本资源协作组(西部联盟),以同标、同质、共赢、共享作为协作宗旨,以同心共筑规范化建设、同力推进可持续发展作为协作目标,建设多病种西北网络联盟库,协作组成员单位共同成长,也为我院多学科、多中心研究项目实施奠定基础。

队伍建设:

目前中心全职工作人员共计17人,其中副高及以上4人,专职科研人员3人。拥有生物信息学、医学检验学、药学、细胞生物学、结构生物学、微生物学、流行病与卫生统计学专员、计算机科学等多专业领域研究和技术人才。同时,样本库引进蛋白质科学领域杰出科学家共同建设蛋白质科学研究平台。聚焦微生物入侵机制及耐药机制的研究,在耐药靶点发现和抗菌药物研发中寻求突破,在噬菌体耐药菌治疗中探索新技术与新方向。

科研成果:

20195月开始我院样本库开始纳入首例生物样本至今,样本库已保藏入库样本约40万。正逐步面向全院各学科开展生物样本保藏工作。其中包括11个国家区域医疗中心建设项目,以及多项国家级、省部级的重大科研项目,和起步阶段孵化库的建设项目。目前33个临床科室、60余项科研项目样本入库、300余项课题利用干湿两库资源开展研究工作,文章发表包括European Heart Journa1IF 29.983),JAMA Internal MedicineIF 21.837),Molecular Psychiatry IF 15.992)等一大批高质量临床研究的科研论文,为全院科学研究提供重要支撑。

近三年来中心团队共获得国家重点研发计划子课题2项,国家科技重大专项子课题1项,国家自然科学基金2项,省级基金6项,横向课题2项。近3年来发表SCI论文16篇,其中IF>102篇(PNASNucleic Acids Research),IF>54篇。

联系电话:029-85324461

电子邮箱:jdyfybiobank@163.com

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